Your browser doesn't support javascript.
loading
Show: 20 | 50 | 100
Results 1 - 15 de 15
Filter
1.
Braz. j. biol ; 83: 1-7, 2023. tab, ilus
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1468938

ABSTRACT

The karyotype and constitutive heterochromatin pattern of the white stork Ciconia ciconia samples obtained from Manzala lake, Dimiaat, Egypt was described. Somatic cells of Ciconia ciconia samples have diploid number 2n= 68 chromosomes. Out of 68 chromosomes, 11 pairs including sex chromosomes were macrochromosomes and the remaining pairs were microchromosomes. Of the 11 macrochromosome pairs, no.1, 2, 4 and 5 were submetacentric and pairs no. 6, 7 and 8 were described as metacentric. In addition, the autosome pair no.3 was subtelocentric, while autosome pair no.9 was acrocentric. Also, the sex chromosome Z represents the fourth one in size and it was classified as submetacentric while, W chromosome appeared as medium size and was acrocentric. Furthermore, C-banding pattern (constitutive heterochromatin) revealed variation in their sizes and occurrence between macrochromosomes. Pairs no. 7 and 8 of autosomes exhibited unusual distribution of heterochromatin, where they appeared as entirely heterochromatic. This may be related to the origin of sex chromosomes Z and W. However, there is no sufficient evidence illustrate the appearance of entirely heterochromatic autosomes. Therefore, there is no available cytogenetic literature that describes the C-banding and karyotype of Ciconia Ciconia, so the results herein are important and may assist in cytogenetic study and evolutionary pattern of Ciconiiformes.


O cariótipo e o padrão constitutivo de heterocromatina das amostras de cegonha-branca Ciconia ciconia obtidas no lago Manzala, Dimiaat, Egito, foram descritos. As células somáticas de amostras de Ciconia ciconia possuem número diploide 2n = 68 cromossomos. Dos 68 cromossomos, 11 pares incluindo cromossomos sexuais eram macrocromossomos e os pares restantes eram microcromossomos. Dos 11 pares de macrocromossomos, os nos 1, 2, 4 e 5 eram submetacêntricos, e os pares nos 6, 7 e 8 foram descritos como metacêntricos. Além disso, o par de autossomos no 3 era subtelocêntrico, enquanto o par de autossomos no 9 era acrocêntrico. Além disso, o cromossomo sexual Z representa o quarto em tamanho e foi classificado como submetacêntrico, enquanto o cromossomo W apareceu como de tamanho médio e acrocêntrico. Além disso, o padrão de bandamento C (heterocromatina constitutiva) revelou variação em seus tamanhos e ocorrência entre macrocromossomos. Pares nºs 7 e 8 dos autossomos exibiram distribuição incomum de heterocromatina, onde apareceram como totalmente heterocromáticos. Isso pode estar relacionado à origem dos cromossomos sexuais Z e W. No entanto, não há evidências suficientes para ilustrar o aparecimento de autossomos totalmente heterocromáticos. Portanto, não há literatura citogenética disponível que descreva o bandamento C e o cariótipo de Ciconia ciconia, portanto os resultados aqui apresentados são importantes e podem auxiliar no estudo citogenético e no padrão evolutivo de Ciconiiformes.


Subject(s)
Animals , Birds/genetics , Karyotyping/veterinary , Heterochromatin/isolation & purification
2.
Braz. j. biol ; 832023.
Article in English | LILACS-Express | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1469154

ABSTRACT

Abstract The karyotype and constitutive heterochromatin pattern of the white stork Ciconia ciconia samples obtained from Manzala lake, Dimiaat, Egypt was described. Somatic cells of Ciconia ciconia samples have diploid number 2n= 68 chromosomes. Out of 68 chromosomes, 11 pairs including sex chromosomes were macrochromosomes and the remaining pairs were microchromosomes. Of the 11 macrochromosome pairs, no.1, 2, 4 and 5 were submetacentric and pairs no. 6, 7 and 8 were described as metacentric. In addition, the autosome pair no.3 was subtelocentric, while autosome pair no.9 was acrocentric. Also, the sex chromosome Z represents the fourth one in size and it was classified as submetacentric while, W chromosome appeared as medium size and was acrocentric. Furthermore, C-banding pattern (constitutive heterochromatin) revealed variation in their sizes and occurrence between macrochromosomes. Pairs no. 7 and 8 of autosomes exhibited unusual distribution of heterochromatin, where they appeared as entirely heterochromatic. This may be related to the origin of sex chromosomes Z and W. However, there is no sufficient evidence illustrate the appearance of entirely heterochromatic autosomes. Therefore, there is no available cytogenetic literature that describes the C-banding and karyotype of Ciconia Ciconia, so the results herein are important and may assist in cytogenetic study and evolutionary pattern of Ciconiiformes.


Resumo O cariótipo e o padrão constitutivo de heterocromatina das amostras de cegonha-branca Ciconia ciconia obtidas no lago Manzala, Dimiaat, Egito, foram descritos. As células somáticas de amostras de Ciconia ciconia possuem número diploide 2n = 68 cromossomos. Dos 68 cromossomos, 11 pares incluindo cromossomos sexuais eram macrocromossomos e os pares restantes eram microcromossomos. Dos 11 pares de macrocromossomos, os nos 1, 2, 4 e 5 eram submetacêntricos, e os pares nos 6, 7 e 8 foram descritos como metacêntricos. Além disso, o par de autossomos no 3 era subtelocêntrico, enquanto o par de autossomos no 9 era acrocêntrico. Além disso, o cromossomo sexual Z representa o quarto em tamanho e foi classificado como submetacêntrico, enquanto o cromossomo W apareceu como de tamanho médio e acrocêntrico. Além disso, o padrão de bandamento C (heterocromatina constitutiva) revelou variação em seus tamanhos e ocorrência entre macrocromossomos. Pares nos 7 e 8 dos autossomos exibiram distribuição incomum de heterocromatina, onde apareceram como totalmente heterocromáticos. Isso pode estar relacionado à origem dos cromossomos sexuais Z e W. No entanto, não há evidências suficientes para ilustrar o aparecimento de autossomos totalmente heterocromáticos. Portanto, não há literatura citogenética disponível que descreva o bandamento C e o cariótipo de Ciconia ciconia, portanto os resultados aqui apresentados são importantes e podem auxiliar no estudo citogenético e no padrão evolutivo de Ciconiiformes.

3.
Braz. j. biol ; 83: e248814, 2023. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1339390

ABSTRACT

Abstract The karyotype and constitutive heterochromatin pattern of the white stork Ciconia ciconia samples obtained from Manzala lake, Dimiaat, Egypt was described. Somatic cells of Ciconia ciconia samples have diploid number 2n= 68 chromosomes. Out of 68 chromosomes, 11 pairs including sex chromosomes were macrochromosomes and the remaining pairs were microchromosomes. Of the 11 macrochromosome pairs, no.1, 2, 4 and 5 were submetacentric and pairs no. 6, 7 and 8 were described as metacentric. In addition, the autosome pair no.3 was subtelocentric, while autosome pair no.9 was acrocentric. Also, the sex chromosome Z represents the fourth one in size and it was classified as submetacentric while, W chromosome appeared as medium size and was acrocentric. Furthermore, C-banding pattern (constitutive heterochromatin) revealed variation in their sizes and occurrence between macrochromosomes. Pairs no. 7 and 8 of autosomes exhibited unusual distribution of heterochromatin, where they appeared as entirely heterochromatic. This may be related to the origin of sex chromosomes Z and W. However, there is no sufficient evidence illustrate the appearance of entirely heterochromatic autosomes. Therefore, there is no available cytogenetic literature that describes the C-banding and karyotype of Ciconia Ciconia, so the results herein are important and may assist in cytogenetic study and evolutionary pattern of Ciconiiformes.


Resumo O cariótipo e o padrão constitutivo de heterocromatina das amostras de cegonha-branca Ciconia ciconia obtidas no lago Manzala, Dimiaat, Egito, foram descritos. As células somáticas de amostras de Ciconia ciconia possuem número diploide 2n = 68 cromossomos. Dos 68 cromossomos, 11 pares incluindo cromossomos sexuais eram macrocromossomos e os pares restantes eram microcromossomos. Dos 11 pares de macrocromossomos, os nos 1, 2, 4 e 5 eram submetacêntricos, e os pares nos 6, 7 e 8 foram descritos como metacêntricos. Além disso, o par de autossomos no 3 era subtelocêntrico, enquanto o par de autossomos no 9 era acrocêntrico. Além disso, o cromossomo sexual Z representa o quarto em tamanho e foi classificado como submetacêntrico, enquanto o cromossomo W apareceu como de tamanho médio e acrocêntrico. Além disso, o padrão de bandamento C (heterocromatina constitutiva) revelou variação em seus tamanhos e ocorrência entre macrocromossomos. Pares nos 7 e 8 dos autossomos exibiram distribuição incomum de heterocromatina, onde apareceram como totalmente heterocromáticos. Isso pode estar relacionado à origem dos cromossomos sexuais Z e W. No entanto, não há evidências suficientes para ilustrar o aparecimento de autossomos totalmente heterocromáticos. Portanto, não há literatura citogenética disponível que descreva o bandamento C e o cariótipo de Ciconia ciconia, portanto os resultados aqui apresentados são importantes e podem auxiliar no estudo citogenético e no padrão evolutivo de Ciconiiformes.


Subject(s)
Animals , Sex Chromosomes/genetics , Heterochromatin/genetics , Birds , Karyotype , Karyotyping
4.
BAG, J. basic appl. genet. (Online) ; 33(1): 43-49, Oct. 2022. graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1420284

ABSTRACT

ABSTRACT Cytogenetic evidence indicates that Zea, which comprises maize (Z. mays ssp. mays) and its wild relatives, is an allopolyploid genus. Our research group has carried out numerous cytogenetic studies on Zea species, mainly focused on native Argentinian and Bolivian maize landraces. We found a wide inter- and intraspecific genome size variation in the genus, with mean 2C-values ranging between 4.20 and 11.36 pg. For the maize landraces studied here, it varied between 4.20 and 6.75 pg. The objectives of this work are to analyze the causes of genome size variation and to discuss their adaptive value in Zea. This variation is mainly attributed to differences in the heterochromatin located in the knobs and to the amount of interspersed DNA from retrotransposons. Polymorphisms in presence or absence of B-chromosomes (Bs) and the population frequency of Bs are also a source of genome size variation, with doses ranging between one and eight in the landraces analyzed here. Correlation analysis revealed that the percentage of heterochromatin is positively correlated with genome size. In addition, populations cultivated at higher altitudes, which are known to be precocious, have smaller genome sizes than do those growing at lower altitudes. This information, together with the positive correlation observed between the length of the vegetative cycle and the percentage of heterochromatin, led us to propose that it has an adaptive role. On the other hand, the negative relationship found between Bs and heterochromatic knobs allowed us to propose the existence of an intragenomic conflict between these elements. We hypothesize that an optimal nucleotype may have resulted from such intranuclear conflict, where genome adjustments led to a suitable length of the vegetative cycle for maize landraces growing across altitudinal clines.


RESUMEN La evidencia citogenética indica que el género Zea, el maíz (Z. mays ssp. mays) y sus parientes silvestres, posee un origen alopoliploide. Nuestro grupo de investigación ha realizado numerosos estudios en especies de Zea, principalmente en maíces nativos de Argentina y Bolivia. En este género, hallamos una amplia variación inter e intraespecífica en el tamaño del genoma, con valores 2C medios que oscilan entre 4,20 y 11,36 pg. El valor 2C medio de los maíces nativos estudiados varió entre 4,20 y 6,75 pg. Los objetivos de este trabajo son analizar las causas de la variación del tamaño del genoma en Zea y discutir su valor adaptativo. Esta variación se atribuye principalmente a las diferencias en la heterocromatina de los knobs y en la cantidad de ADN intercalado de los retrotransposones. Otras fuentes de variación son los polimorfismos para presencia/ausencia de cromosomas B (Bs) y para la frecuencia poblacional de Bs en las razas analizadas, con dosis que oscilan entre uno y ocho Bs. El porcentaje de heterocromatina se correlaciona positivamente con el tamaño del genoma. Las poblaciones cultivadas en altitudes altas, que son precoces, tienen tamaños de genoma más pequeños que las que crecen en bajas altitudes. Esta información, junto con la correlación positiva observada entre la duración del ciclo vegetativo y el porcentaje de heterocromatina, nos llevó a proponer el rol adaptativo de la heterocromatina. Por otro lado, la relación negativa encontrada entre Bs y knobs heterocromáticos nos permitió proponer la existencia de un conflicto intragenómico entre estos elementos. Hipotetizamos que de este conflicto intranuclear habría resultado el nucleotipo óptimo, donde ajustes genómicos condujeron a una duración adecuada del ciclo vegetativo en las razas de maíz que crecen a lo largo de clines altitudinales.

5.
BAG, J. basic appl. genet. (Online) ; 33(1): 89-95, Oct. 2022. graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1420289

ABSTRACT

ABSTRACT Zephyranthes citrina is an ornamental American bulbous plant used as an ornamental garden crop for the aesthetic qualities of its yellow perigonium. The objective of this work was to characterize the species by classical chromosome staining and fluorochrome banding. A sporophytic chromosome number of 2n=8x=48 chromosomes was observed, being the karyotypic formula 20 m + 26 sm + 2 st. Satellites were detected in the short arm of metacentric chromosomes 8, 9, 11 and 12, which colocalized with constitutive heterochromatin CMA+/DAPI-/0 bands. The karyotype comprised chromosome pairs with terminal constitutive heterochromatin bands that included satellites and heteromorphic clusters indicating that it is an allooctoploid. These results will be used as a tool for monitoring genetic improvement, in interspecific crosses and its progenies and in biotechnological procedures by in vitro culture.


RESUMEN Zephyranhtes citrina es una planta bulbosa americana, ornamental, utilizada en jardines por las cualidades estéticas de su perigonio amarillo. El objetivo de este trabajo fue caracterizar citogenéticamente la especie con tinción clásica convencional y bandeo cromosómico. Se observó un número cromosómico esporofítico de 2n=8x=48, siendo la fórmula cariotípica 20 m + 26 sm + 2st. Se detectaron satélites en el brazo corto de los cromosomas metacéntricos 8, 9, 11 y 12, que co-localizaron con bandas de heterocromatina constitutiva CMA+/DAPI-. El cariotipo comprendió pares de cromosomas con bandas de heterocromatina constitutivas terminales que incluyeron satélites y grupos heteromórficos que indican que es un alooctoploide. Estos resultados serán usados como herramientas en el monitoreo del mejoramiento genético, en análisis de cruzamientos interespecíficos y progenies y en procedimientos biotecnológicos de cultivo in vitro.

6.
Rev. chil. obstet. ginecol. (En línea) ; 87(2): 104-110, abr. 2022. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1388716

ABSTRACT

INTRODUCCIÓN: La infertilidad es una enfermedad multicausal y el componente genético representa uno de sus principales eventos. Si bien la distribución de la infertilidad puede variar entre poblaciones, las parejas de los países con bajos y medianos ingresos pueden verse más afectadas por la infertilidad, con una proporción de alteraciones citogenéticas aún no esclarecidas. OBJETIVO: Evaluar la frecuencia de alteraciones citogenéticas y su correlación con el número de abortos en pacientes peruanas con diagnóstico de infertilidad. MÉTODO: Se realizó un estudio de corte transversal en 400 pacientes de 18 a 60 años, de ambos sexos, con diagnóstico de infertilidad. Se registraron las características clínicas disponibles durante el examen genético y el análisis citogenético convencional fue con bandeo GTG en muestras de sangre periférica. El análisis de correlación se realizó con la prueba de Spearman. RESULTADOS: Del total, 389 pacientes cumplieron los criterios de inclusión, y de estos, 169 (43,44%) tuvieron reportes de abortos (promedio: 2,25, rango: 1-7). Hallamos una correlación significativa ente el número de abortos y las alteraciones citogenéticas (p < 0,000). Reportamos 25/289 (6,43%) alteraciones cromosómicas, de las que 11/25 (44%) fueron heterocromatinas constitutivas y 6/25 (24%) fueron translocaciones reciprocas. Las alteraciones citogenéticas más frecuentes fueron 16qh+ y 9qh+ (ambas con un 16%), y afectaron a 17 (68%) varones. CONCLUSIONES: Existe una moderada frecuencia de alteraciones citogenéticas en pacientes peruanos con diagnóstico de infertilidad, y las alteraciones más frecuentes fueron heterocromatina constitutivas. Además, evidenciamos una correlación significativa ente el número de abortos y las alteraciones citogenéticas.


INTRODUCTION: Infertility is a multicausal disease and the genetic component represents one of its main events. Although the distribution of infertility may vary between populations, couples in low-and-middle-income countries may be more affected by infertility with a proportion of cytogenetic alterations still unclear. OBJECTIVE: To evaluate the frequency of cytogenetic alterations and their correlation with the number of abortions in Peruvian patients with a diagnosis of infertility. METHOD: A cross-sectional study was carried out in 400 patients between 18 and 60 years-old, of both genders with a diagnosis of infertility. The clinical characteristics available during the genetic examination were recorded and the conventional cytogenetic analysis was with GTG banding in peripheral blood samples. The correlation analysis was performed with the Spearman test. RESULTS: Of the total 389 patients who met the inclusion criteria, of these 169 (43.44%) patients had reports of abortions (mean: 2.25, range: 1-7). We found a significant correlation between the number of abortions and cytogenetic alterations (p < 0.000). We report 25/289 (6.43%) chromosomal alterations, where 11/25 (44%) were constitutive heterochromatin, and 6/25 (24%) were reciprocal translocations. The most frequent cytogenetic alterations were 16qh + and 9qh + (both 16%), and affected 17 (68%) men. CONCLUSIONS: There is a moderate frequency of cytogenetic alterations in Peruvian patients diagnosed with infertility, where the most frequent alterations were constitutive heterochromatin. Furthermore, we evidenced a significant correlation between the number of abortions and cytogenetic alterations.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Adolescent , Adult , Middle Aged , Young Adult , Abortion, Spontaneous/epidemiology , Infertility/diagnosis , Infertility/genetics , Peru , Heterochromatin , Abortion, Spontaneous/genetics , Cross-Sectional Studies , Chromosome Aberrations , Cytogenetic Analysis , Abortion
7.
Neotrop. ichthyol ; 19(1): e200103, 2021. tab, mapas, ilus
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1154963

ABSTRACT

Parodontidae is a relatively small group of Neotropical characiform fishes consisting of three genera (Apareiodon, Parodon, and Saccodon) with 32 valid species. A vast cytogenetic literature is available on Apareiodon and Parodon, but to date, there is no cytogenetic data about Saccodon, a genus that contains only three species with a trans-Andean distribution. In the present study the karyotype of S. wagneri was described, based on both conventional (Giemsa staining, Ag-NOR, C-bands) and molecular (repetitive DNA mapping by fluorescent in situ hybridization) methods. A diploid chromosome number of 2n = 54 was observed in both sexes, and the presence of heteromorphic sex chromosomes of the ZZ/ZW type was detected. The W chromosome has a terminal heterochromatin band that occupies approximately half of the long arm, being this band approximately half the size of the Z chromosome. The FISH assay showed a synteny of the 18S-rDNA and 5S-rDNA genes in the chromosome pair 14, and the absence of interstitial telomeric sites. Our data reinforce the hypothesis of a conservative karyotype structure in Parodontidae and suggest an ancient origin of the sex chromosomes in the fishes of this family.(AU)


Parodontidae é um grupo relativamente pequeno de peixes caraciformes neotropicais que consiste em três gêneros (Apareiodon, Parodon e Saccodon) com 32 espécies válidas. Uma vasta literatura citogenética está disponível sobre Apareiodon e Parodon, mas até o momento não há dados citogenéticos sobre Saccodon, um gênero que contém apenas três espécies com distribuição transandina. No presente estudo foi descrito o cariótipo de S. wagneri, baseado em métodos convencionais (coloração de Giemsa, Ag-NOR, bandas C) e moleculares (mapeamento de DNA repetitivo por hibridização fluorescente in situ). Um número cromossômico diplóide de 2n = 54 foi observado, e a presença de cromossomos sexuais heteromórficos do tipo ZZ/ZW foi revelada. O cromossomo W possui uma banda terminal heterocromática que ocupa aproximadamente metade do braço longo, sendo esta banda aproximadamente a metade do tamanho do cromossomo Z. O ensaio FISH mostrou uma sintenia dos genes 18S-rDNA e 5S-rDNA no par de cromossomos 14, e a ausência de sítios teloméricos intersticiais. Nossos dados reforçam a hipótese de uma estrutura cariotípica conservadora em Parodontidae e sugerem uma origem ancestral dos cromossomos sexuais nos peixes desta família.(AU)


Subject(s)
Animals , Sex Chromosomes , Heterochromatin , Cytogenetics , Characiformes/genetics , Gender Identity
8.
Braz. j. biol ; 77(3): 642-654, July-Sept. 2017. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-888785

ABSTRACT

Abstract The populations of Artemia (or brine shrimp) from the Americas exhibit a wide variation in the amount of interphase heterochromatin. There is interest in understanding how this variation affects different parameters, from the cellular to the organismal levels. This should help to clarify the ability of this organism to tolerate brine habitats regularly subject to strong abiotic changes. In this study, we assessed the amount of interphase heterochromatin per nucleus based on chromocenter number (N-CHR) and relative area of chromocenter (R-CHR) in two species of Artemia, A. franciscana (Kellog, 1906) (n=9 populations) and A. persimilis (Piccinelli and Prosdocimi, 1968) (n=3 populations), to investigate the effect on nuclear size (S-NUC). The relationship of the R-CHR parameter with the ionic composition (IC) of brine habitats was also analysed. Our results indicate a significant variation in the amount of heterochromatin both within and between species (ANOVA, p<0.001). The heterochromatin varied from 0.81 ± 1.17 to 12.58 ± 3.78 and from 0.19 ± 0.34% to 11.78 ± 3.71% across all populations, for N-CHR and R-CHR parameters, respectively. N-CHR showed less variation than R-CHR (variation index 15.5-fold vs. 62-fold). At least five populations showed a significant association (p<0.05) between R-CHR and S-NUC, either with negative (four populations, r= from -0.643 to -0.443), or positive (one population, r= 0.367) values.Within each species, there were no significant associations between both parameters (p>0.05). The R-CHR and IC parameters were associated significantly for the magnesium ion (r= 0.496, p<0.05) and also for the chloride, sodium and calcium ions (r = from -0.705 to -0.478, p<0.05). At species level, a significant association between both parameters was also found in A. franciscana populations, for the sulphate and calcium ions, in contrast to A. persimilis. These findings suggest that the amount of interphase heterochromatin modifies the nuclear size in Artemia. Our data also indicate that change in the amount of interphase heterochromatin is in line with the ionic composition of brines. This would be a species-specific phenomenon, whose occurrence may be involved in the ability of this organism to survive in these environments.


Resumo As populações de Artemia (ou camarão de salinas) das Américas apresentam uma grande variação na quantidade de heterocromatina interfásica. Há interesse em compreender como esta variação afeta diferentes parâmetros, desde o nível celular até os organismos. Isso deve ajudar a esclarecer a capacidade destes organismos tolerarem habitats extremos de água hipersalinas, que normalmente são submetidos a fortes mudanças abióticas. Neste estudo, avaliou-se a quantidade heterocromatina interfásica por núcleo através do número de cromocentros (N-CHR) e a área relativa de cromocentros (R-CHR) em duas espécies de Artemia, A. franciscana (Kellog, 1906) (n=9 populações) e A. persimilis (Piccinelli e Prosdocimi, 1968) (n=3 populações), para investigar o seu efeito no tamanho nuclear (S-NUC). Também foi analisada a relação de R-CHR com a composição iónica (CI) dos habitats hipersalinos. Nossos resultados indicam uma variação significativa na quantidade de heterocromatina dentro e entre espécies (ANOVA, p<0,001). Em todas as populações, a heterocromatina variou de 0,81 ± 1,17 para 12,58 ± 3,78 e de 0,19 ± 0,34% para 11,78 ± 3,71% para os parâmetros R-CHR e N-CHR, respectivamente. N-CHR apresentou menor variação do que R-CHR (amplitude de variação de 15,5 vezes vs. 62 vezes). Pelo menos cinco populações apresentaram uma associação significativa (p<0,05) entre R-CHR e S-NUC, seja com valores negativos (quatro populações, r = -0,643 a -0,443) ou positivo (uma população, r = 0,367). Os parâmetros R-CHR e CI foram associados significativamente para o íon de magnésio (r = 0,496, p<0,05) e também para os íons cloreto, sódio e cálcio (r = -0,705 a -0,478, p<0,05). Ao nível de espécie, foi também encontrada uma associação significativa entre esses dois parâmetros em populações de A. franciscana para os íons de sulfato e de cálcio, em contraste com A. persimilis. Estes achados sugerem que a quantidade heterocromatina interfásica modifica o tamanho nuclear em Artemia. Os nossos dados também indicam que a mudança na quantidade de heterocromatina interfásica está associada com a composição iónica das salinas. Este seria um fenómeno específico da espécie, cuja ocorrência pode estar envolvida na capacidade deste organismo sobreviver em tais ambientes.


Subject(s)
Animals , Artemia/physiology , Heterochromatin/chemistry , Salinity , Artemia/growth & development , South America , United States , Cell Nucleus/chemistry , Ecosystem , Interphase , Larva/growth & development , Larva/physiology
9.
Braz. j. biol ; 74(1): 251-256, 2/2014. graf
Article in English | LILACS | ID: lil-715586

ABSTRACT

Kerodon acrobata is a caviidae rodent endemic from Brazilian Cerrado. It was described only in 1997 and the data about it is very scarce. The aim of this work was to characterize the karyotype of K. acrobata. Giemsa staining, nucleolar organizer region (NOR) banding, C-positive heterochromatin banding and DAPI fluorescence were used in N metaphases of a specimen collected in Asa Branca Farm, in Aurora do Tocantins municipality, Tocantins state, Brazil. K. acrobata showed the same diploid number, fundamental number and chromosome morphology as Kerodon rupestris. But its NOR location and heterochromatin distribution patterns indicated a unique cytogenetic profile when compared to its sister species, emphasizing the evolutionary uniqueness of this relatively new and unknown species. This record also extends the distribution of this species northward.


Kerodon acrobata é um roedor caviídeo endêmico do Cerrado brasileiro. A espécie foi descrita apenas em 1997, e as informações sobre ela são muito escassas. O objetivo deste trabalho foi caracterizar o cariótipo K. acrobata. Coloração em Giemsa, bandeamento da região organizadora do nucléolo, bandeamento da heterocromatina C-positiva e fluorescência DAPI foram utilizados em N metáfases de um espécime coletado na fazenda Asa Branca, na cidade de Aurora do Tocantins, estado do Tocantins, Brasil. K. acrobata apresentou o mesmo número diplóide, número fundamental e morfologia dos cromossomos de Kerodon rupestris. Mas a localização de sua NOR e os padrões de distribuição de heterocromatina indicam um perfil citogenético único quando comparado com sua espécie irmã, enfatizando a singularidade evolutiva desta espécie pouco conhecida. Este registro também estende a distribuição desta espécie em direção ao norte.


Subject(s)
Animals , Female , Chromosome Banding , Karyotyping , Rodentia/genetics , Brazil , Diploidy , Rodentia/classification
10.
Acta biol. colomb ; 17(2): 323-336, mayo-ago. 2012. ilus, graf, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-659300

ABSTRACT

Las ardillas colombianas muestran una gran variabilidad citogenética lo que ha despertado el interés en ahondar aspectos evolutivos en el grupo. Para esto, varias herramientas de bandeo cromosómico convencional como bandas diferenciales Q y R y bandas no diferenciales C y NOR fueron analizadas permitiendo, por primera vez en las ardillas colombianas, detectar señales de cromosómicas inusuales de replicación e inactivación de heterocromatina y cromosomas marcadores específicos. Se explica la utilidad de cada uno de estos complementos en el análisis citogenético de especies y las observaciones para los citotipos de las ardillas colombianas.


Colombian Squirrels cytogenetics showed a great variability which has renewed the interest in evolutionary aspects within the group. Many chromosome banding tools must be analyzed carefully in addition to the classical G-banding G technique. These techniques include other differential bands like Q and R banding and nondifferential banding (C and NOR). In this article the use of each of these supplements in the cytogenetic analysis of species and cytotypes observations for the Colombian squirrels is explained.

11.
Acta biol. colomb ; 16(3): 61-70, dic. 2011.
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-635101

ABSTRACT

En el año 2000 se presentó lo que se dio en llamar nuestro libro de la vida, el primer borrador del genoma humano. Aquello generó grandes expectativas por sus potenciales en beneficio de las ciencias biológicas. ¿Qué ha sucedido diez años después? Se conoce el número de genes que forman parte de nuestro genoma y se determinó la función de algunos de ellos. Se conocen las secuencias de tres genomas completos de mamíferos, Mus musculus, Pan troglodytes y Sus scrofa y genomas completos o borradores de otros numerosos eucariota (otros animales, plantas, hongos y protistas) y procariota (Archea y Bacterias), ver: http://ncbi.nlm.nih.gov/genomes. Sin embargo, el estudio del genoma no se limita a la mera descripción de las secuencias que lo componen. Las respuestas que se elaboren tendrán enfoques muy diversos, desde evolución y conservación de la biodiversidad hasta terapia génica y transformación maligna, donde el estudio de las particularidades individuales y poblacionales requiere fuentes de información tanto pasadas como actuales sobre estos genomas en estudio. Así, los avances en ciencia siempre son provisorios y por tanto, plausible de continuarse, completarse e incluso reinterpretarse ya que, conforme avanzamos en el conocimiento van surgiendo nuevos interrogantes.


In 2000 the first draft of the human genome, what became known as our book of life, was presented. It generated high expectations for its potential applications to the benefit of the biological sciences. What happened 10 years later? We know how many genes we have in our genome and analyzed the function of some of them. Nowadays, we know the sequences of 3 mammalians genomes: M. musculus, P. troglodytes y S. scrofa and the genomes or borradores from other eucaryotes (other animals, plants, fungi and protists) and procaryotes (Archea and Bacterias). However, the study of the genome is not merely a description of the sequences that compose it. The answers provided will have very different approaches from evolution and conservation of biodiversity to gene therapy and malignant transformation, where the study of individual and population particularities requires sources of information both past and present on these genomes under survey. Thus, advances in science are always provisional and therefore liable to be continued, completed and even reinterpreted as we advance in knowledge, new questions arise.

12.
Braz. j. biol ; 67(4,supl): 945-950, Dec. 2007. ilus, tab
Article in English | LILACS | ID: lil-474236

ABSTRACT

The chromosome modal number in Muscoidea Diptera is 2n = 12, including five pairs of autosomes and one sex chromosome pair. Nevertheless, some species with 2n = 10 chromosomes have been described, all of them from the Muscidae family. We analyzed the karyotype of some Muscidae species from different subfamilies and compared the obtained data with the karyotypes of some species of the families Calliphoridae and Sarcophagidae. Comparisons of these species with other Muscidae species revealed a considerable variation among their sex chromosomes. This variation in the length of the sex chromosomes suggests that parts of these chromosomes were lost or fused with autosomes. The constitutive heterochromatic regions and the nucleolar organizer regions (NORs) were also analyzed and some aspects about the relationship between these regions and the sex chromosomes are discussed.


O número modal de cromossomos dos Dípteros Muscóideos é 2n = 12, incluindo cinco pares de autossomos e um par de cromossomos sexuais. No entanto, algumas espécies com 2n = 10 cromossomos já foram descritas, sendo todas pertencentes à família Muscidae. No presente trabalho, foram analisados os cariótipos de algumas espécies de Muscidae de diferentes subfamílias e os dados obtidos foram comparados com os cariótipos de algumas espécies das famílias Calliphoridae e Sarcophagidae. Comparações destas espécies com outras da família Muscidae revelaram uma considerável variação entre seus cromossomos sexuais. Esta variação no tamanho dos cromossomos sexuais sugere que parte destes cromossomos foram perdidos ou sofreram fusão com autossomos. As regiões de heterocromatina constitutiva e as regiões organizadoras de nucléolos (RONs) foram também analisadas e alguns aspectos sobre a relação destas com os cromossomos sexuais são discutidos.


Subject(s)
Animals , Female , Male , Chromosome Banding/methods , Diptera/genetics , Heterochromatin/genetics , Sex Chromosomes/genetics , Diptera/classification , In Situ Hybridization, Fluorescence , Nucleolus Organizer Region/genetics
13.
Braz. j. biol ; 67(4)Nov. 2007.
Article in English | LILACS-Express | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1467918

ABSTRACT

The chromosome modal number in Muscoidea Diptera is 2n = 12, including five pairs of autosomes and one sex chromosome pair. Nevertheless, some species with 2n = 10 chromosomes have been described, all of them from the Muscidae family. We analyzed the karyotype of some Muscidae species from different subfamilies and compared the obtained data with the karyotypes of some species of the families Calliphoridae and Sarcophagidae. Comparisons of these species with other Muscidae species revealed a considerable variation among their sex chromosomes. This variation in the length of the sex chromosomes suggests that parts of these chromosomes were lost or fused with autosomes. The constitutive heterochromatic regions and the nucleolar organizer regions (NORs) were also analyzed and some aspects about the relationship between these regions and the sex chromosomes are discussed.


O número modal de cromossomos dos Dípteros Muscóideos é 2n = 12, incluindo cinco pares de autossomos e um par de cromossomos sexuais. No entanto, algumas espécies com 2n = 10 cromossomos já foram descritas, sendo todas pertencentes à família Muscidae. No presente trabalho, foram analisados os cariótipos de algumas espécies de Muscidae de diferentes subfamílias e os dados obtidos foram comparados com os cariótipos de algumas espécies das famílias Calliphoridae e Sarcophagidae. Comparações destas espécies com outras da família Muscidae revelaram uma considerável variação entre seus cromossomos sexuais. Esta variação no tamanho dos cromossomos sexuais sugere que parte destes cromossomos foram perdidos ou sofreram fusão com autossomos. As regiões de heterocromatina constitutiva e as regiões organizadoras de nucléolos (RONs) foram também analisadas e alguns aspectos sobre a relação destas com os cromossomos sexuais são discutidos.

14.
Braz. j. biol ; 67(2): 333-338, May 2007. ilus, tab
Article in English | LILACS | ID: lil-460007

ABSTRACT

Cytogenetic analyses were performed in two Curimatidae species (Steindachnerina insculpta and Cyphocharax modesta) from the Paranapanema and Tietê Rivers (São Paulo State, Brazil), showing a karyotype composed of 54 meta-submetacentric chromosomes in both species. Silver- and chromomycyn-staining and fluorescent in situ hybridization (FISH) using a 18S rDNA probe indicated that the nucleolar organizer regions (NORs) of both species are localized in the terminal region of the long arm of two metacentric chromosomes. Although a single NOR system was evidenced in both analyzed species, S. insculpta and C. modesta presented the nucleolar organizer regions in distinct chromosome pairs, indicating that these cistrons can be considered cytogenetic markers. Variation on the amount and distribution of the constitutive heterochromatin (C-bands) could also be detected between the two species - while S. insculpta presented few heterochromatic blocks, intensely stained C-bands were evidenced in C. modesta specially in the terminal region of the long arm of the NOR-bearing chromosomes. Although most Curimatidae species have been characterized by homogeneous karyotypes, isolated populations could be established under different environmental conditions leading to karyotype micro-structure variations specially related to the NORs localization and C-banding distribution. The obtained data were useful for the cytogenetic characterization and differentiation of S. insculpta and C. modesta and could be used in evolutionary inferences in the Curimatidae group.


Análises citogenéticas foram realizadas em duas espécies de Curimatidae (Steindachnerina insculpta e Cyphocharax modestus) provenientes dos rios Paranapanema e Tietê (Estado de São Paulo, Brasil), evidenciando um cariótipo composto por 54 cromossomos meta-submetacêntricos em ambas as espécies. Coloração com nitrato de prata e cromomicina e hibridação in situ fluorescente (FISH), utilizando uma sonda de DNAr 18S, mostraram que as regiões organizadoras de nucléolos (RONs) de ambas as espécies estão localizadas na região terminal do braço longo de dois cromossomos metacêntricos. Embora as espécies analisadas tenham apresentado um sistema de RONs simples, S. insculpta e C. modesta apresentaram as regiões organizadoras de nucléolos em distintos pares de cromossomos, indicando que estes cístrons podem ser considerados marcadores citogenéticos. Variação na quantidade e distribuição de heterocromatina constitutiva (bandas C) também pôde ser detectada entre as duas espécies - enquanto S. insculpta apresentou poucos blocos heterocromáticos, bandas C intensamente coradas foram evidenciadas em C. modesta especialmente na região terminal do braço longo dos cromossomos portadores de RONs. Embora a maioria das espécies de Curimatidae seja caracterizada por cariótipos homogêneos, populações isoladas podem ter se estabelecido sob condições ambientais distintas, levando à ocorrência de variações na micro-estrutura cariotípica especialmente relacionadas à localização das RONs e à distribuição das bandas C. Os dados obtidos mostraram-se úteis para caracterização e diferenciação citogenética de S. insculpta e C. modesta e podem ser utilizados em inferências evolutivas no grupo Curimatidae.


Subject(s)
Animals , Male , Female , Chromosome Banding , Fishes/genetics , In Situ Hybridization, Fluorescence , Nucleolus Organizer Region/genetics , /analysis , Brazil , Coloring Agents , Fishes/classification , Heterochromatin , Karyotyping , Rivers
15.
Semina ciênc. agrar ; 27(4): 679-684, out.-dez. 2006. ilus
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-464870

ABSTRACT

Foram analisados citogeneticamente 14 indivíduos de tilápia do Nilo, Oreochromis niloticus que fazem parte do estoque de reposição de reprodutores da Estação de Piscicultura da Universidade Estadual de Londrina, Paraná, Brasil. Todos os indivíduos apresentaram o mesmo número diplóide de 44 cromossomos. As NORS foram observadas em quatro cromossomos com marcações em posição terminal do braço curto e a hibridação "insitu" (FISH) com sonda de 18S também evidenciou a presença de dois pares de cromossomos contendo cístrons ribossômicos. O tratamento com os fluorocromos CMA d DAPI, respectivamente, não mostrou bandas brilhantes em nenhum cromossomo do complemento. A banda C (CBG)evidenciou, regiões de heterocromatina distribuídas em vários cromossomos nas regiões centroméricas, sendo observadas algumas marcações em regiões teloméricas, principlamente no maior par de cromossomos do complemento, um par apresentou-se quase totalmente heterocromático. Os resultados obtidos estão de acordo com os dados disponíveis na literatura, porém, quando analisadas as bandas C e as NORs, foram evidenciadas algumas diferenças que aparentemente caracterizam a população local de peixes da Universidade Estadual de Londrina


14 specimens of Nile's tilapia were analyzed cytogenetically, Oreochromis niloticus, that belong to thestock of fish breeding from the Freshwater Aquaculture Station of the Londrina State University in theParaná, Brazil. All specimens presented the same disploid number of 44 chromosomes. The NORs wereobserved in four chromosomes with marks in terminal position of the short arm and the hybridization "insitu" (FISH) with probe of 18 S also evidenced the presence of two pairs of chromosomes containingribbosomic cistrons. The treatment with the fluochromes CMA3 and DAPI, respectively, didn't showshinning bands in any chromosome of the complement. The band C (CBG) evidenced regions ofheterochromatin distributed on several chromosomes in the centromeric regions, being observed somemarks in telomeric regions, mainly on the biggest pair of chromosomes of the complement, a pair presenteditself almost totally heterochromatic. The obtained results are in accordance with the data found inliterature, nevertheless when the C bands and NORs were analyzed, were evidenced some differencesthat apparently characterized the local fish population of the Londrina State University


Subject(s)
Cichlids , Cytogenetics , Heterochromatin , Fishes , Fisheries , Tilapia
SELECTION OF CITATIONS
SEARCH DETAIL